Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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