Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
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