Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RabggtaQ9JHK4 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RabggtaQ9JHK4 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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