Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PtprtQ99M80 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprtQ99M80 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms