Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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