Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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Sft2d1Q5SSN7 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Sft2d1Q5SSN7 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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Sft2d1Q5SSN7 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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Sft2d1Q5SSN7 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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Sft2d1Q5SSN7 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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