Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms