Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Sh3bp2Q06649 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Sh3bp2Q06649 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms