Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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