Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SbdsP70122 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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