Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TspoP50637 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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TspoP50637 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TspoP50637 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TspoP50637 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TspoP50637 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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TspoP50637 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TspoP50637 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TspoP50637 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC2.59□□□□□ -2
TspoP50637 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TspoP50637 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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TspoP50637 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TspoP50637 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TspoP50637 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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