Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
VdrP48281 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
VdrP48281 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
VdrP48281 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
VdrP48281 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VdrP48281 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VdrP48281 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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