Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtpraP18052 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms