Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
Sptan1P16546 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Sptan1P16546 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms