Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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DffaO54786 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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DffaO54786 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DffaO54786 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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DffaO54786 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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