Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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