Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc6D3YZP9 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.4 ms