Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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