Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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