Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms