Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Ccdc88cQ6VGS5 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms