Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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NipblQ6KCD5 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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NipblQ6KCD5 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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NipblQ6KCD5 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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NipblQ6KCD5 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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NipblQ6KCD5 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NipblQ6KCD5 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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