Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Mkrn3Q60764 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Mkrn3Q60764 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms