Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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