Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Rnf40Q3U319 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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