Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms