Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Hoxd1Q01822 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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Hoxd1Q01822 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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Hoxd1Q01822 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Hoxd1Q01822 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Hoxd1Q01822 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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