Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms