Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CntfrO88507 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CntfrO88507 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CntfrO88507 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CntfrO88507 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CntfrO88507 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CntfrO88507 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CntfrO88507 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms