Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
DffaO54786 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DffaO54786 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
DffaO54786 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
DffaO54786 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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DffaO54786 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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DffaO54786 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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DffaO54786 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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DffaO54786 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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DffaO54786 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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DffaO54786 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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DffaO54786 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DffaO54786 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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