Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ArxO35085 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ArxO35085 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ArxO35085 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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