Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Gm2056J3QQ02 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm2056J3QQ02 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm2056J3QQ02 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm2056J3QQ02 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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Gm2056J3QQ02 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm2056J3QQ02 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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