Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Srp54bE9PXC0 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Srp54bE9PXC0 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Srp54bE9PXC0 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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