Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Grik3B1AS29 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Grik3B1AS29 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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Grik3B1AS29 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Grik3B1AS29 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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