Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc9bA3KGF9 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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