Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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