Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Limd1Q9QXD8 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Limd1Q9QXD8 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Limd1Q9QXD8 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Limd1Q9QXD8 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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Limd1Q9QXD8 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Limd1Q9QXD8 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Limd1Q9QXD8 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Limd1Q9QXD8 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Limd1Q9QXD8 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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