Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms