Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr414-202ENSMUST00000192358 4526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RabggtaQ9JHK4 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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