Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Ccdc47Q9D024 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Ccdc47Q9D024 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms