Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf40Q3U319 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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