Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
Trim71Q1PSW8 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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