Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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