Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SbdsP70122 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
SbdsP70122 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SbdsP70122 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SbdsP70122 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms