Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SrprbP47758 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms