Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms