Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PdgfraP26618 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms