Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sdc4O35988 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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