Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm42616-201ENSMUST00000198989 4184 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms