Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CtcflA2APF3 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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